シロー憧れの女性教師・森山優子がヤヌス侯爵にさらわれ、戦闘獣・マリゲラの内部に取り込まれてしまった。さすがのグレートマジンガーも人質を取られては手も足も出ず、隙をついて攻撃しようとするとロボットジュニアやボスボロットに阻まれる始末。打つ手なしの状況を救ったのは、開発中のＸ線レーザー発生機だった。