ついに誕生した第3のプリキュア、キュアサンシャイン。その力は、いつきが武術の達人だったこともあって、強敵のデザトリアンさえも圧倒しました。そして、ついにシャイニータンバリンを取り出したサンシャインは、決め技『プリキュア・ゴールドフォルテバースト』で、デザトリアンを浄化して、お兄さんであるさつきのこころの花カモミールを取り返すことに成功します。無事、元に戻って勇気を取り戻すことができたさつきは、予定通り手術を受けることになりました。それを見守るいつきたち。そのとき、ポプリたち妖精が、こころの大樹が近くに来ていることに気がつきました。
新しいプリキュア、サンシャインの誕生を知って、会いに来たというこころの大樹ですが、いる場所は雲の上です。そこでシプレたちがマントに変身して、つぼみたちを空へ飛べるようにしてくれました。さっそうと空を飛んで、つぼみ、えりか、いつきは、こころの大樹のいるところへと向かいます。かつてダークプリキュアによって元気を失ったこころの大樹でしたが、つぼみたちがみんなのこころの花を元気にしたことで、今では元のような姿に戻りつつありました。花のつぼみもできて、元気になったこころの大樹の姿に喜ぶつぼみたち。でも、そこへダークプリキュアがやって来ました。