「俺だってな、狸野郎にこき使われるのだけはまっぴらだ」（ねずみ男）
ついに八百八狸によって征服されてしまった日本政府。この状況を打開すべく妖怪獣：大ナマズを封印しようと富士山に向かう鬼太郎たち。だがその行く手を妖怪獣・蛟竜が立ち塞がった。鬼太郎はこの強敵を倒すため、胃液となって蛟竜ごと溶けるという捨て身の技によりかろうじて勝利する。そして再生粉末によってなんとか命を繋いだ鬼太郎は、仲間たちに八百八狸の封印を頼むと、満身創痍のまま国連軍と戦う大ナマズの元へと急いだ！