釣りをしていた少年の前に不思議な老人が現われ、釣った魚と魚眼丸という丸薬とを交換した。魚眼丸を飲んだ少年は、体中からウロコが生えて魚になってしまう。目玉おやじは少年を助けるため、井戸仙人から譲り受けた魚眼丸を鬼太郎たちに飲ませる。鬼太郎たちは魚に姿を変え、少年を捜すため海に潜る。