カードとなったハンター・キバマルを1000年の封印から復活させたハガンは、
真宝門に消えたハルカを必死で探すが発見することは叶わなかった。
そんな二人の前に現れたのは、唯一人1000年を生きてきたハンター・パーンだった。

パーンは　1000年の間に起きた事件やハンターカードの謎を語る。

パーンの導きで二人はハガンの元居た世界へと帰還するが、
<そこに待ち受けていたのは敵、ゴードの僕のハンター・ヒルデであった！