「ついに巡り会えたぞ、一万年に一人現われるという悪魔くんに！」（ファウスト博士）
学校で悪魔くんとあだ名されている小学生・埋れ木真吾。今日も悪魔を呼び出す実験に没頭するが、またしても失敗に終わってしまう。落胆して帰る途中、真吾は街で悪魔の百目に出会い、喜んで家に迎える。そしてある日、彼は百目に怪しい場所へと案内され、普通の人間には見えない「見えない学校」を目の当たりにした！