「オレの予感は、腹時計と同じくらい正確だぞ」(トチロー)
戦争中、ハーロックが指揮していた戦艦・デスシャドウ号。トチローの設計した名艦が、敵として目の前に立ちふさがった。艦を指揮するのはベンツェル、地球の元軍人という雇われ艦長だ。デスシャドウ号の人工知能には、戦闘時のハーロックのクセが残らずインプットされている。しかもベンツェルは、ハーロックたちが宇宙のならず者から救った少女レビとドクター蛮を、人質として艦内に監禁していた…。