「男とかメンツとか、そういったクラシックな考えは苦手でな」(トチロー)
ドクロの旗を掲げ、大宇宙をまたにかける女・エメラルダス。彼女もハーロックやトチローと共にイルミダス支配下の地球から逃れ、第一級指名手配犯として賞金をかけられたお尋ね者になっていた。イルミダスは彼女を罠にかけて捕らえ、ハーロックを誘き寄せるエサにしようと人質に取る。彼女と志を同じくするハーロックと想いを寄せるトチローは、罠が待ち構えている事を承知で救出に向かう。