もう一体の聖なるデジモンのパートナー・ヒカリをダークナイトモンから取り戻すため、太一の戦いは続く。ようやくヒカリとダークナイトモンとの再会を果たし、太一は戦いを挑む。だがヒカリは太一が助けようと伸ばした手をとることなく、まるで自らの意志のようにしてダークナイトモンの体内にとりこまれていったのである。ヒカリはなぜ、太一の手をとらなかったのか。その目的は何か。ついに打倒ミレニアモンに向けて、事態は大きく動き出した。