ミレニアモンとの決戦を乗り越えた太一たちに、かつて共に戦ったガーベモンから連絡が入った。彼らのデジヴァイスに浮かぶ紋章とそっくりなものが「情報の大樹」という場所にあるという。急ぎ向かった太一たちはガーベモンと再会し、デジタルワールドの情報を集めて研究しているワイズモンと出会う。その「情報の大樹」の一角には、8つの紋章が刻まれた石版が浮かぶ部屋があった。太一たちはそこで、「選ばれし子供たち」のさらなる使命を知る。