「オレたちは人間だ、でももう半分はデジモンなんだ！」（拓也）
激闘の末、拓也たちはついにケルビモンを倒した。しかし、デジタルワールドの虫食いだらけの大地は何も変わらない。原因を突き止めようと山に向かった拓也たちは、そこでバロモンと出会った。バロモンによると、ケルビモンが悪に染まった原因はルーチェモンにあるらしい。ケルビモンはルーチェモンによって、復活のためのデジコードを集めさせられていたというのだ。驚く拓也たちの前に、新たなる脅威・ロイヤルナイツが現れる！