倉田が爆破させた時限振動爆弾の影響で、次元の壁が崩れてしまった!!　バンチョーレオモンがデジソウルで支えてくれているが、このままではデジタルワールドと人間界、二つの世界が衝突するのは時間の問題。そうなれば、両方が消滅することになるだろう…。バンチョーレオモンは言った。二つの世界を救うため、イグドラシルに会え…と。そこでマサルたちは、再びデジタルワールドに乗り込むことを決意。さっそく行動に移し、意外な再会を果たす…。

マサルたちが再会したのは、かつて敵対したはずのゴツモンだった!!　だが彼は妙に親切で、敵対心らしきものは感じさせない。一度デジタマに戻されているし…。もしかして記憶を失っている?　とにかく、「いい人」になっていたゴツモンの案内でイグドラシルのいる世界樹をめざしたマサルたちは、そこで彼らを阻む新たな『強敵』と遭遇した!!　彼の名は『クレニアムモン(究極体)』。イグドラシルを守護する『ロイヤルナイツ』のひとりだ!!

イグドラシルには絶対に会わせないと立ちはだかるクレニアムモン。彼のパワーは強大!!　そして強固!!　どこまでも強固!!　究極体の4体攻撃でも、決して揺るがなかった!!　これがロイヤルナイツの実力…。瞬く間に叩きのめされるシャイングレイモンたち。だがマサルがクレニアムモンの槍を素手で受け、力任せに押し倒した事で逆転。これで倒せるか…!?　誰もがそう思ったその時…!!

マサルたちの前に、ロイヤルナイツが大集合した!!　しかも続けざまに、また新たな人物が現れる。それはマサルの父『スグル』…。いや、今の彼はスグルではない。デジタルワールドの神『イグドラシル』だったのだ!!　彼は冷酷に告げる。人間界を消滅させる…と。もはや父と子の関係さえ断ったようなイグドラシルの冷酷さ。マサルたちにも身の危険が迫る…。だが、そこへ謎のデジモンが飛来した。彼はマサルたちを回収すると、そのまま一気に飛び去る。いったい、彼は何者なのか…!?