中学一年生の工藤タイキは困っている人を放っとけないお人好し。そんなタイキの耳に、ある日、不思議なメロディとともに謎の声が聞こえてくる。もうすぐ死ぬ、と弱弱しい声を励ますタイキの前に、突如出現した赤く輝くクロスローダー。思わず手にしたタイキは、陽ノ本アカリ、剣ゼンジロウとともに異世界に吸い込まれてしまう。

異世界に行ったタイキたちを襲ってくるバグラ軍のデジモン・マッドレオモン。謎の声の導くままにタイキがクロスローダーをリロードすると、声の主、シャウトモンが飛び出した。しかし巨大化したマッドレオモンに歯が立たないシャウトモン。タイキはクロスローダーを掲げ、シャウトモンとバリスタモン、スターモン、ピックモンズをデジクロスで合体させる。見事、勝利するシャウトモンX2。タイキ、アカリ、ゼンジロウは改めてシャウトモンから話を聞く。「お前知らないのか、ここがデジタルワールドだって事！」その言葉に愕然とするタイキたちで―――。