「俺がマザーコンピューターの代わりになれんことはないはずだ」（サコン）
奇妙な彗星が急速に地球へと接近していた。知的生命体の精神エネルギーを食料とするスパイダーズ彗星だ。彗星の出現を予想していたサコンは、対抗策としてゼウスミサイルを完成させる。だが、発射直前に人喰いアメーバが侵入。大空魔竜の乗組員はシールドルームへの避難を余儀なくされる。もはや残された時間はない。人喰いアメーバの精神攻撃にただ一人耐えたサコンは、破壊されたコンピューターの代わりに自分の脳を大空魔竜に接続する！