花子という少女の家の周囲に不思議な花が生えた。鬼太郎が相談されて調査に向かうが、花の正体は一向に判然としない。鬼太郎は花子を連れ、花の種が飛んできた方向を目指して南の島へ向かう。小鬼の襲撃を受けるなどの障害を乗り越えながら、一行はジャングルの奥にたどり着き、そこで驚くべきものを見つける…。