山奥の村で子供たちが次々と行方不明になった。調査の依頼を受けた鬼太郎が現地に赴くと、そこには毛むくじゃらで訛りの強い妖怪・毛羽毛現がいた。人間を嫌う彼は子供たちをさらい、その魂を化石に移して恐竜を復活させることで、地上を太古の時代に戻そうとしていたのだ。毛羽毛現の術は強力で、恐竜たちまで現れて大暴れを始める！