ある村で大根が大量に盗まれる事件が起きた。山奥に棲むという伝説の妖怪が犯人だろうと、村人たちは鬼太郎に事件の解決を依頼する。依頼を受けた鬼太郎だが、自分が事件を解決して依頼金をせしめようとするねずみ男に何かと邪魔をされてしまう。そんなある日、ねずみ男の前に弟子入りを希望する男が現れる。実はその男こそ、大量の大根を盗んでいった妖怪だった！