過去から脱出するのと引き換えに記憶を失ってしまったみらい、リコ、ことは、モフルン。
だが、記憶を辿る長い旅の果てに彼女たちはようやく再会を果たすことができた。

全員揃ったみらいたちはプリキュアに変身。モフルンもキュアモフルンとなり、4人は過去に力をもらって未来に進むという強い思いでクロノウストに立ち向かう。
そしてアレキサンドライトスタイルの力で、ついにクロノウストを撃退。
止められた時を取り戻した。

石像から解放された人々は、元の日常へ。
過去に囚われていたアイルも、前に進めるようになったのだろうか……？
その真偽は不明だが、問題を片づけたみらいたちは自分たちの未来へ歩き始めることに。
魔法ガールとして人助けを続けるみらいとモフルン。
ナシマホウ界で出張授業をする傍ら、みらいの活動を手伝うことにしたリコ。
そして、みらいたちと一緒にいると決めたことは。
彼女たちのワクワクな毎日はこれからも続いていく。