ドクターヘルは忍術を身につけた小型機械獣・ブラザスＳ１とＳ２に密命を与え、研究所に向かわせた。マジンガーＺは出撃する際、わずかだか無防備になる時間がある。そこに小型コバルト爆弾を仕掛けて爆破しようというのだ。その頃、研究所の前に赤ん坊を捨てた理沙という女がいた。何もかも失って独りになった彼女は、死に場所を求めて山中をさまよううち、赤ん坊を捨てた研究所にブラザスの爆弾が仕掛けられていることを知る。