南極に仕掛けられた秘密メカ「デッドヒーター」。それが放つ熱エネルギーによって、12時間後には地球全土が未曾有の洪水に見舞われる危機に直面していた。南の島で休日を過ごしていたレインボー戦隊は、世界連邦からの召集を受けて調査を開始、南極へと急行する。