星空みゆきは中学2年生の女の子。今日は七色ヶ丘に引っ越して、はじめての登校日です。遅刻しそうで急いでいると、空から本が飛んできました。しかも中から何か飛び出します。現れたのはキャンディという絵本の国の妖精でした。絵本が大好きなみゆきは大喜びしますが、キャンディはどこかへ行ってしまいます。そしてみゆきはキャンディの残した本を拾いました。今のことは夢じゃないと思いつつも、みゆきは学校へ急ぎます。はじめての学校でみゆきは自己紹介をしますが、緊張で何を言ったらいいかわからなくなりました…

そんなみゆきを助けたのは去年、転校してきたというあかねでした。あかねはスポーツ万能のなお、学級委員のれいか、泣き虫のやよいなど、クラスのみんなを次々に紹介します。その紹介で緊張がとけたみゆきは、絵本が大好きなことをみんなにアピールできました。放課後、キャンディのことが気になったみゆきは、学校を探検することを決めます。そして図書室で光る本を見つけました。さわっているうちに本は輝きを増し、みゆきを吸い込んでしまいます。そのころ何かを探していたキャンディの前に、ウルフルンが現れました。

みゆきが迷い込んだのは本が並ぶ不思議な世界でした。その本のすき間からキャンディを見つけたみゆきが拾った本を差し込むと本棚が輝きだします。そしてみゆきをキャンディのいる所へと導きました。キャンディはウルフルンに襲われ大ピンチ、思わずみゆきはキャンディを助けて逃げ出します。でも、すぐに追いつかれてしまいました。そのとき、みゆきのもとにスマイルパクトが現れます。キャンディの言うとおりスマイルパクトを使うとみゆきはプリキュアに変身しました。キラキラ輝く未来の光キュアハッピーの誕生です。

変身したハッピーですが、まだ自分の力を知りません。しかもウルフルンはアカンベェという怪物まで生み出してきました。思わず逃げ出すハッピーでしたが、途中で自分がすごい力を持っていることに気づきます。反撃に出たハッピーはキャンディの言うとおり、スマイルパクトに気合を込めて癒しの力『プリキュア・ハッピーシャワー』を放ちました。その威力の前にアカンベェは浄化され、キュアデコルへと姿を変えます。それを見て逃げ出すウルフルン。すべてが終わってキャンディからいろいろなことを聞くみゆきは、プリキュアとしてハッピーエンドを目指すため、これからもガンバることを決めるのでした。