今日から二泊三日の修学旅行。京都へ向かう新幹線の中で、みゆきはうれしさのあまり大はしゃぎです。でも、おやつを食べようとバックを開けたら中身は空っぽ、全部キャンディに食べられてしまいました。でも、みゆきは怒りません。それは今がとってもウルトラハッピーだからです。そして、いよいよ京都に着いたみゆきたちは、金閣寺を見学にやって来ました。みんなと楽しく金閣寺を見ていたみゆきでしたが、誤って池に落ちてしまいます。みゆきは気を取り直しておみくじを引いてみますが、出たのはなんと大凶でした。

おみくじが大凶でも、最初は気にもしなかったみゆきでしたが、写真に映らなかったり、おみやげが壊れてしまったりと散々な目にあい、だんだんと落ち込んでしまいます。でも、なおたちからこれからよくなると励まされ、みゆきは気を取り直しました。しかし、宿ではちょっとした失敗から先生に怒られて、大変な目にあってしまいます。こうして、みゆきの修学旅行1日目は、さんざんなまま終わってしまいました。そのころ、テレビを見ていたアカオーニは、おとぎ話の舞台にそっくりだと、京都へ向かっていたのです。

翌日、修学旅行2日目。清水寺や祇園を見学するみゆきたち。でも、またしてもみゆきはドジばかり。相変わらず、まだ大凶のようです。そんなとき、アカオーニがバッドエナジーを集め始めました。それに気づいたみゆきたちは駆けつけて、プリキュアに変身します。しかしキュアハッピーに変身しても、みゆきの大凶は変わりません。ドジばかりでアカオーニに笑われてしまいます。しかも、レインボーヒーリングの準備をしようとしたそのとき、スマイルパクトを池に落としてしまいました。ハッピーはあわてて川の中を探します。

自分のドジでピンチを招いたハッピーは責任を感じますが、みんなはそんなことはないと励ましてくれました。その気持ちに応えるようにスマイルパクトは川の中から現れます。そして、プリキュアは見事にレインボーヒーリングを決め、青っ鼻のアカンベェを浄化しました。事件も解決してみゆきはあらためてみんなに謝ります。でも、みゆきのドジを思い出し、みんなは思わず笑顔になりました。そして、明るい雰囲気につつまれます。その効果で大凶もどこかに消えてしまったのか、運が良くないと見れないという舞妓さんたちに出会うことができました。こうして、みゆきにウルトラハッピーが戻ったのです。