ある日、みゆきは学校の図書室で不思議な本を見つけます。表紙に描かれたガラスの靴をながめていたみゆきは、その本の中へと吸い込まれてしまいます。その本の名は『はじまりのシンデレラ』。世界中のシンデレラとつながっている本でした。そして、この本がバッドエンドになれば、世界中のシンデレラがバッドエンドになってしまうのです、そのことを知っているウルフルンたちが本を奪いにやって来ますが、本から出た不思議な光で吸い込まれてしまいました。さらにその光はキャンディたちも本の中へ吸い込んでしまいます。

あこがれのシンデレラになって大喜びのみゆき。物語の最後には王子様と結ばれてハッピーエンドになれると思っていたみゆきでしたが、ウルフルンたちが物語をバッドエンドに変えようと、イジワルな姉たちや継母になって姿を現しました。このみゆきのピンチを救うため、キャンディたちもシンデレラに登場するキャラクターになって助けにやって来ます。でも、魔女役のやよいが捕まってしまったり、お城に行くカボチャの馬車がウルフルンに壊されてしまったりと、次々にシンデレラのみゆきにピンチがおとずれるのでした。

お城でシンデレラを待つ王子様役のれいか。でも、現れたのはウルフルンたちだけでした。ほかの人たちもウルフルンたちにジャマされて来られなかったのです。でも魔法のほうきに乗ったみゆきが駆けつけ、無事に王子様とシンデレラはダンスを踊ることができました。そしていよいよシンデレラがガラスの靴を落とす場面です。しかし、ウルフルンたちがガラスの靴をアカンベェに変えてしまいました。プリキュアに変身するしかないと構えるみゆきでしたが、みんなはスマイルパクトを現実世界に置いてきてしまっていたのです。

たったひとりでアカンベェをガラスの靴に戻そうとガンバるキュアハッピー。12時にまであまり時間はありません。でも、みゆきのシンデレラに対する愛が、ハッピーにいつも以上の力を与えたのです。プリンセスフォームに変身したハッピーは、たったひとりでアカンベェをガラスの靴に戻すと、12時前に家へと戻るのでした。そして翌日、またジャマしようとするウルフルンたちを抑え、みゆきはガラスの靴を履いてシンデレラをハッピーエンドで終わらせます。くやしそうに逃げていくウルフルンたち。物語はちょっと変わってしまいましたが、みゆきたちは無事にシンデレラをハッピーエンドにしたのでした。