ついにプリキュアが5人そろいました。でも、これから何をすればいいかわかりません。キャンディに聞いてもわからないみたいです。困っていたところに、ふたたび絵本が飛んできて、新しい妖精が現れました。名前はポップ、キャンディのお兄ちゃんです。ポップはプリキュアの使命を話すため、キャンディが持ってきた絵本のある「ふしぎ図書館」へみんなを連れて行きました。そのころ、バッドエンド王国にいた三幹部のところにも、何者かがやって来ていたのです。それは不気味な仮面をしたジョーカーという変な人でした。

ふしぎ図書館に着いたみんなに、ポップは絵本「伝説の戦士プリキュア」を読み聞かせ始めます。ある日、メルヘンランドにバッドエンド王国の皇帝ピエーロが攻めてきました。キュアデコルを奪われたものの、メルヘンランドの女王ロイヤルクイーンはピエーロを封印します。でも、ロイヤルクイーンも封印され、後のことをキャンディに託しました。そしてキャンディは、キュアデコルを取り戻し、ロイヤルクイーンを復活させるため、プリキュアを集めたのです。それを聞いたみんなは、ようやくプリキュアの目的を知りました。

そのころ、マジョリーナが現れ、みんなを暗い気持ちに変えてしまいました。そのことを知ったみんなは、心に願った場所へ行けるという本棚の力で、マジョリーナがいる場所に向かいます。でも、行く前にペンギンを見てしまったみゆきは、間違って南極に行ってしまいました。迷子になったみゆきを迎えに、ポップは南極へ追いかけに行きます。南極でふたりっきりになったポップは、みゆきに妹のキャンディのことをヨロシクとお願いしました。みゆきも、キャンディに笑顔でいてもらうようにすることを、ポップと約束します。

みゆきが到着してついに全員集合、みんなはプリキュアに変身します。5つの光が導く未来！輝けスマイルプリキュア！みゆきの考えたキメポーズをとり、みんなの笑顔を守るスマイルプリキュアが名乗りを上げました。ポップの変化の術に助けられ、アカンベェを浄化したプリキュアは、キュアデコルを手に入れます。そして、プリキュアの使命を教えに来たポップは、メルヘンランドでの任務のため、帰ることになりました。寂しくて思わず泣いてしまうキャンディですが、ポップのお別れのときは笑顔でという約束を思い出し、笑顔を取り戻します。そんなキャンディを、みゆきたちは優しく抱きしめるのでした。