歴史を歪めようと行動してきたフジミトラベラーズの黒幕である不二見。だが、その正体は全身メカの高性能ロボットだった。ロボット不二見の真の目的は、パンドラボックスを使い世界そのものを消滅させること。その恐ろしい真実を知ったフジミトラベラーズはパンドラボックスを奪って逃走。だが、必死に逃げる最中に逃走者たちの乗る時空列車と衝突してしまった。その影響で時間転移した先は、1943年のフィラデルフィア。フジミトラベラーズは全ての事情を逃走者たちに伝え、団結してロボット不二見の野望を阻止しようとするが……。