海底基地建設の資材を集めるため、ベガ星連合軍の部隊が隠密行動を開始した。津波を起こして臨海工業地帯を破壊し、ガレキを持ち去るという作戦だ。災害の報せを受けたダイザーチームは現地に飛ぶが、まさかそれがベガ星連合軍の仕業だとは夢にも思わない。調査を受けていた甲児たちは、突然の攻撃を受けてしまう。