999の路線に、突如現れた不定形の惑星ほどもある巨大生命体。意志はあるが自力では動けない様子の星にめり込み、999は脱出することもできず、沈んでいく。999を救うために、鉄道警備局が惑星を破壊しようと、震動波を発射することを決定。そんな中、透明な体をした女性が宇宙船で飛び込んできて…。