水の遺跡を探検し、ミコトはとうとうアクアストーンを手に入れた。しかしそこに現れたのは、またしてもディアガー一味だった。ディアガーはアクアストーンを渡せとミコトに強要。ミコトはディアガーのしてきた事、そして自分が得た様々な経験を振り返り、ディアガーと闘う事を決意するのだった。水の力を持つミコト、そして炎の力を持つディアガー……二人の決戦が今始まる。