一連の怪現象の鍵を握る謎の者がいるという空中古代都市。そこに到着した宙たちの前にブルムロードモンが立ちはだかり、中には入れないと言い、究極進化したガンマモンたちと激しいバトルに及ぶが、ガンマモンに戻ってしまった彼はグルスに進化、さらに凶暴なレグルスモンに進化してしまった。
だがその時、何者かの仕業で宙たち一同はインナースペースに飛ばされ、宙が一計を案じた事で、何とレグルスモンとカノーヴァイスモンが別々の体として分離する。ところが、黒い因子GRBの力によりレグルスモンは異常に強く狡猾で、シリウスモンと互角に戦ったどころか罠を仕掛け、シリウスモンに致命傷を与えてしまうのだった……！