ヨシノが高熱を出して倒れてしまった!!　しかもマサルたちを倒そうと鼻息荒くやってきたイクトにまで症状が伝染し、パートナーのファルコモンは慌てて撤退するはめになる。謎の発熱の原因はウイルス。しかしワクチンがなくては手の打ちようがない。このままではヨシノの命が…。ファルコモンが再び現われたのは、まさにその時だった。イクトを助けるため、心底嫌う人間たちと手を組もうというのである…。

サルたちはヨシノを救うため、ファルコモンはイクトを助けるため、共に『流れ者の岬』を目指すことにした。ファルコモンによると、その場所は『汚れた場所』としてデジモンたちから忌み嫌われている所らしい。何でもその昔、人間が住んでいたとか…。その人間が残したワクチンならヨシノたちを救えるようなのだ。だが、彼らの動きを察知したゴツモンは、ファルコモンが人間に寝返ったものと断定して、『ブロッサモン(完全体)』を送り込もうとする。

ファルコモンは禁忌の地に足を踏み入れる事を恐れていた。だが怖がってはいられない…すべてイクトのため!!　そう勇気を振り絞り、基地らしき建物へと入っていく。そこでコンピューター端末を発見したトーマは、ここがどんな施設なのかを調べようとするが…。一方、ワクチンを探して奥に入っていったマサルやファルコモンは、ブロッサモンの襲撃を受けていた!!　その中でマサルは、ファルコモンを『仲間』として守ろうとする。

「男は絶対仲間を裏切らねぇ!!　オマエはちっぽけな勇気を振り絞って、ここへ案内してくれた男の中の男。だからオレはオマエを信じる!!」…手放しでファルコモンを信じ、先に逃げるよう言うマサル。その心意気に、ファルコモンの心が揺さぶられた!!　あれだけ嫌っていた人間…。だが今は、マサルたちに対して別の感情が芽生え始めている。そしてすべてが解決した後、彼はわずかな葛藤を自身の中に感じ取り、複雑な心境に陥るのだった…。