これまで対立していた暗黒大将軍とアルゴス長官が、闇の帝王の命令で手を組んだ。その頃、シローは自慢の凧をテストしようと、ハルナを誘っていた。しかし約束の時間になっても彼女は現れない。なんとハルナは戦闘獣キリニアの体内に捕らわれていたのだ！　グレートマジンガーやビューナスＡは人質に翻弄されて･･･。