ついにプリキュアたちの前に、砂漠の王デューンが現れました。キュアフラワーを連れて行こうとするデューンに対して、キュアブロッサム、キュアマリン、キュアサンシャイン、キュアムーンライトは果敢に挑みます。でも、砂漠の使徒の支配者だけあってデューンは強敵でした。プリキュアたちは次々とその攻撃の前にはじき飛ばされ、変身がとけてしまいます。そして最後に残ったキュアフラワーも、デューンに倒されてしまいました。すかさず助けに入ったコッペも簡単に倒し、デューンは余裕の表情です。そこへサバーク博士が迎えにやって来て、デューンはおばあちゃんを連れ去ってどこかへ消えてしまいました。
デューンはおばあちゃんのペンダントを砕きます。すると、その体は成長していき、以前に持っていた力を取り戻しました。ペンダントにはかつてキュアフラワーが封印していたデューンの力が閉じ込められていたのです。力を取り戻したデューンは、その手でこころの大樹を枯らし、地球に大量のデザートデビルを送り込みました。翌日の朝、植物園で目を覚ましたつぼみたちは、シプレたちからこころの大樹が枯れてしまったことを聞いてビックリします。さらに外へ出てみると、辺り一面が荒れ果てた砂漠に姿を変えていました。つぼみたちは家族が心配になって、コッペに植物園を任せて自分たちの家へと急ぎます。