三角山の村人たちは、一年もの間、一滴も雨が降らないために困り果てていた。そこで鬼太郎に助けを求めに行くが、鬼太郎より早くねずみ男が来ており、金儲けのために高名な雨山博士を騙して人工雨を降らせようと企む。だが、ヘリで飛び立った博士の一行は雨雲の中に入ったきり戻らなかった。どうやら電気妖怪かみなりの仕業らしい…。