スイーツの世界にいる響が手当たり次第お菓子を食べていると、またもや響の名前を呼ぶ謎の声が聞こえてくる。と、響を起こす団の声。響はスイーツの世界の夢を見ていたのだ。今日は団と一緒に奏の家族やエレンと一緒にハイキングに行く予定の響。9時の待ち合わせまであと30分、響は飛び起きて支度を始める。その頃、奏はハイキングに持っていくお菓子をオーブンに入れてスイッチオン！ 30分で焼きあがるタイマーをセットする。一方、バリトンはメフィストに「いまから30分で世界を不幸の音楽で包んでみせる」と宣言するのだった。

エレンを迎えにいったハミィは、エレンがたくさんの荷物を準備しているのを見てビックリ。荷物を減らして、あと30分で奏の家に向かえるようにとエレンを手伝う。その頃、たった10分で出かける準備を終えた響は、ハミィがいないことに気づき、ハミィを探しに団より早めに家を出る。減らした荷物を手に奏の家に向かうエレンとハミィは町で見かけたトリオ・ザ・マイナーが「トロイの木馬」という謎の作戦をたくらんでいることを知る。作戦をやめさせようとトリオたちの後を追うエレン。そしてハミィはその作戦を知らせるために響と奏のもとへと向かう。

ハミィからトリオ・ザ・マイナーの作戦の話を聞き、エレンのもとへと急ぐ響と奏。一方、加音町の天文台で作戦を実行しようとするトリオ・ザ・マイナーはエレンを捕らえると、天文台のアンテナをネガトーンにし、世界中のラジオに一斉に不幸な音楽を送ろうとする。そこへ響と奏とともにやってきたフェアリートーンたちがエレンを助け、三人はプリキュアに変身！ パワーアップしたネガトーンだったが、ビートの技で動きを止めると、メロディとリズムの決め技で見事ネガトーンを退けるのだった。

作戦に失敗したトリオ・ザ・マイナーは相変わらず互いにその責任をなすりつけあう。一方メロディたちは清々しい気持ちで勝利の余韻にひたっていたが、ビートの一言でハイキングに行く予定だったことを思い出すと、猛ダッシュで集合場所の奏の家へと向かう。無事奏の家の前についたメロディたちは変身をとき、響、奏、エレンとなって姿を現す。奏の焼いていたケーキも完成し、一同は揃って無事ハイキングへと出かけるのだった。